Правопреемником Кыргызского научно-исследовательского института онкологии и радиологии, образовавшегося в 1959 году на основании решения Совета Министров Республики Киргизия, стал Национальный центр онкологии. В новом статусе он принял своих первых посетителей в 2001 году.
На сегодняшний день в Национальном центре онкологии в Бишкеке, который является основным профильным медицинским учреждением, где оказывают специализированную помощь пациентам с онкологическими заболеваниями, занимаются проведением лечебных и профилактических мероприятий. Также специалисты Центра ведут научно-исследовательскую, организационно-методическую работу.
Ежегодно врачи Национального центра онкологии в Бишкеке проводят специализированное лечение пяти с лишним тысячам пациентов, страдающих от онкологических заболеваний. В медицинском учреждении работают высококвалифицированные специалисты, а наличие мощной клинической базы позволяет проводить эффективное лечение. Используя современную рентгенологическую, ультразвуковую, эндоскопическую аппаратуру, а также оборудование для многофункциональной диагностики, специалисты своевременно выявляют патологии в организме, чтобы на основе полученной информации разработать план лечения.